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在和科菲特商量好了组建集团的事以后，萧杰来到了位于蒙特勒伊的法兰西科学院，他需要和科学院展开一些合作，推动这个时代的科技的快速发展。

法兰西科学院的前身是拿破伦在远征埃及的时候建立的埃及科学院，院长由拿破伦非常敬重的学者蒙日担任，后来拿破伦在埃及失败以后，在离开埃及的时候也带着蒙日和一些重要的科学家回到了法国。随后在拿破伦当上第一执政的时候在此基础上建立了法兰西科学院。

埃及科学院建立于1798年8月22日，此举在当时督政府和法国人民的眼里，在历史上以及在埃及人的印象中都被认为是一件好事。但它的意义远不止于此，这得益于蒙日、贝托莱和他们的同事们的积极参与。特别是蒙日，他现在每天都在开罗与拿破伦见面，得以逐渐影响拿破伦，使其认识到以知识分子而不是政客作为组建政府以及政府执政方向的指导力量的重要性。拿破伦一贯喜欢视自己为“公仆”——当然是有学问的公仆(他甚至在发布军事命令时常常签上“科学院院士”的字样)，他在业余时间通常和考古学家、历史学家和科学家在一起，而不是和粗鲁的士兵在一起。这些科学家的非凡创造力使法军不必依赖欧洲本土的后方，而在埃及自给自足地生存下去。

严格说来，当时的埃及科学院有3大目的：一是在埃及传播知识和技术；二是研究埃及的博物学历史、工业和人文历史；三是“为政府出谋献策”——最后一项实际上是其主要的功能，它是埃及第一个完全有组织的科学智囊团。

科学院分成4个部门：数学部(包括蒙日和拿破伦)、物理和政治经济部(包括解救过约瑟芬的前督政塔里昂)和文学艺术部(包括德农，未来的卢浮宫艺术馆馆长)。拿破伦还亲自在缺乏人才的埃及从自己的军官和士兵中选拔合格的科学院成员。

科学院院址设在被没收的马穆鲁克宫廷，离厄尔费宫仅数英里路程。蒙日、贝托莱和其他院士就居住在这两个宫廷里面。同时，在那里还有植物学、物理学和化学实验室、科学资料和埃及古玩以及拉丁文、希腊文和阿拉伯文的图书馆。