大勇担心的只是如果真的进了京，他就不能按照自己的意图行事。对朝堂上的东林党，大勇已经失望透顶，如果可能，他甚至都想举兵进京清君侧，将那些朝廷重臣们全部清洗掉，将他们所代表的集团势力全部抹杀掉，但这样做无疑就是扯旗造反了。

大勇不想造反，也不想受制于人，所以他选择不进京，他要奉调不奉召，他要学祖大寿一样，他认为自己这个选择是对的，至少他还是肯为大明卖命流血的。

在这种矛盾的动机下，大勇当然不想部下们会产生不忠朝廷的想法，他可不想有朝一日会被人黄袍加身。

想到自己这幅残缺狰狞的脸会被人挂在太庙里祭祀，大勇便兴趣淡然。

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军队的改编是在登旅安置使司成立前两个月，大勇将军队改名为辽东新编陆军，简称辽东军，下设骑军、步军、水军三部。

骑兵卫整合了辽东军所有的轻重骑兵，指挥使曹变蛟，副指挥使彭大锤，下辖四营，每营兵2000，马4000，全卫拥兵8000。

陆军第一卫由原步军左营两个千户和皮岛明军合编改建而成，指挥使尚可喜，副指挥使向**，驻地皮岛，下辖五营，每营2000兵，全卫拥兵10000。

陆军第二卫由原步军左营另两个千户及沈阳新降汉军、辽南原明军俘虏青壮合编改建而成，指挥使由从锦州大牢解救出的黄安担任，副指挥使则是耿仲明，同样也是辖五营兵，计10000人。

陆军第三卫则在步军右营基础上扩编成立，指挥使李大山，副指挥使林俊义，也是下辖五营兵，计10000人。

陆军第四卫则由大勇亲兵营及辎重营、辽南青壮合编而成，指挥使由邵武担任，副指挥使宋庆，全卫拥兵10000人。

又设旅顺卫，指挥使李忠辅，副指挥使张存仁。此卫主要由旅顺迁移民青壮和一部分反正汉军组成，主要是承担旅顺守卫，全卫只四营兵8000人。

登州卫指挥使齐三宝，副指挥使王天德，由原辎重营合移民青壮组成，也非野战军，主要是承担登州守卫及地方安靖，全卫五营兵10000人。

原锦州军炮兵营扩建炮兵卫，指挥使由锦州解救出的赵可纲担任，副指挥使陆江，配轻重炮兵四营，计三营9000人。

新设登州炮兵指挥学校，由原川军出身的郭城负责。

新设登州火器研发局，由原锦衣卫南镇抚司工匠出身的麻忠负责。

新设辽东军大营参谋本部，指挥使蒋万里，对外称辽东镇府，对内以参谋部称。

新设辽东军大营护卫亲兵卫，指挥使郭义，副指挥使李固，下设两营4000兵。